樸樹生活照樸樹出生于江蘇省南京市,從小在北京市長大。樸樹“小升初”考試那年,他考了173分,與北京大學附屬中學錄取線173.5分只差0.5分,父親濮祖蔭為此事奔走了一個月,但最終沒有結果。而樸樹的初高中則都是混過來的。1993年,他考上了首都師范大學英語系。大二時,他退了學,每晚10點半,帶著吉他去家門口的小運河邊彈琴唱歌,并開始了寫歌,賣歌的生涯。對于樸樹退學的舉動,他的父母不死心,還找人給其保留了一年學籍,但最終無效,而樸樹的學歷則停留在高中。
樸樹出生在一個知識分子家庭,他的父母都是北京大學的教授；父親濮祖蔭是中國物理學家,研究磁層地球空間物理。樸樹本名為濮樹,后因為加入唱片公司,而改成了更容易寫的“樸”字。他還有一個比其年長6歲的哥哥濮石。受哥哥濮石的影響,他幼年時就知道了羅大佑和崔健。由于哥哥離家去做流浪歌手的叛逆示范,父母對樸樹的管教更加嚴厲。在上高中的時候,他就看過治抑郁癥的醫生,并吃藥治療。1999年,樸樹與女演員周迅因拍攝電影《那時花開》而產生感情；但二人感情沒維持多久便結束。2002年8月,樸樹與女演員吳敏菲在一個朋友的生日舞會上認識；之后,二人開始交往。2005年1月5日,樸樹與吳敏菲登記結婚。
1999年10月,樸樹參加了由Channel發起的“921臺灣大地震——神州賑災搖滾群星傾情傾力大行動”。2003年10月24日,參加“華納音樂十周年慈善演唱會”。2005年1月3日,為東南亞,南亞及非洲部分遭遇海嘯災難的國家進行捐款；1月6日,與一百多名藝人共同參加了“中國人愛心大行動文藝晚會”,旨在救助印度洋地震,海嘯災民；9月,參加“獻給生命的禮物”—紀念《中華人民共和國獻血法》實施七周年主題演唱會,并現場呼喚公益,鼓勵大家無償獻血。2007年9月,參加"時尚環保行"公益活動,并拿出自己在英國購買收藏的電唱留聲機進行拍賣,而拍賣所得善款則全部捐贈給世界環保組織。2008年,為公益短片《2008分之1》創作同名主題曲《2008分之1》；5月,參加了"用音樂為奧運加油,加油中國！加油中國！"主題活動。2017年7月16日,樸樹參加了由周迅工作室發起并主辦的“ONENIGHT給小孩”關愛智力障礙兒童公益演唱會。