宮本蒼野(李亭哲 飾)威脅葉沖(任嘉倫 飾)不要殺他，不然香港那邊就知道他還活著，葉沖沒有理會，和林小莊(劉學義 飾)準備好一切后就離開了倉庫，宮本蒼野則被清泉上野(王勁松 飾)的人當做了檀香(張涵予 飾)繼任者，死在了爆炸中。宮本蒼野的尸體并不完整，清泉上野只拿到了一塊手表。清泉上野要向上海釋放毒氣，不過都被葉沖發現了。葉沖和林小莊回到了香港，和池城再一次相見，這一次他們是同志了。葉沖需要一個工作地方，還有一臺電臺，繼續和清泉上野硬碰硬。靳香(何杜娟 飾)來給葉沖送飯，林小莊連忙拿了進去，池城讓她保持安靜，靳香卻對葉沖很好奇，要和池城一起在門口等。

清泉上野的船被擊沉了，得知那具尸體是宮本蒼野的，清泉上野生氣不已，這才意識到自己被葉沖騙了。但清泉上野并不打算放棄，他很了解葉沖。葉沖收到電訊，對方說如果想要找到剩下毒氣，就來廢棄工廠。葉沖趕了過去，發現清泉上野在那里。然而葉沖走過去時，被清泉上野釋放了毒氣，葉沖再一睜眼，清泉上野已經不見了。

葉沖繼續走了進去，他知道清泉上野一定會在這里等他。清泉上野告訴他，剛才那些氣體都是病毒，他已經吸入了，不到三十四天就會痛苦的死去，他的生命只剩下了最后的三十四天。葉沖已經發病了，清泉上野接著說自己要把這種病毒投放到兩廣，他們會悄悄迎來一場完美的勝利，而且以現在的醫療科學是沒有鑒別出來的，更不要說解藥了，不會有人知道這是病毒。葉沖氣憤不已，清泉上野拿出了唯一的一瓶解藥，他已經服用過了，如果葉沖想要得到就要聯系上下線把所有抵抗力量派遣到這兩座城市。

葉沖怒斥清泉上野失去了做人的底線，可清泉上野根本沒有意識到。葉沖已經知道清泉上野殺害了他的父母，就算他沒有親手殺害江月(李小冉 飾)，也是他害死了江月。清泉上野愛上了江月，他想帶江月和葉沖離開，卻沒想到江月自殺了。清泉上野舉起了槍，他覺得葉沖依舊不夠了解他，這個計劃其實從來都不需要葉沖的配合。病毒已經開始發作，葉沖要經歷漫長的死亡過程，清泉上野喪心病狂地說，他要把這種病毒投放到中國。葉沖拼進最后的力氣朝清泉上野開了槍，清泉上野臨死前，把手上的解藥摔碎了。

林小莊和池城都不知道葉沖中毒的消息，他也沒有說。清泉純子(菅韌姿 飾)得知清泉上野的死訊，心如死灰。葉沖的身體越來越差，卻還強撐著工作。池城找到了毒氣位置，這時清泉純子給葉沖發電報，說還有很多毒氣在她這里，提出和他見面。清泉純子早就該明白葉沖勸她遠離戰爭的目的，她告訴葉沖，所有的答案都在自己身旁的這些黑碼里，如果葉沖破解不了，她就會把這批毒氣投放，幫她的父親完成最后的心愿。清泉純子在葉沖面前自殺，葉沖來不及上前，自己也當場發病暈了過去。葉沖和林小莊、池城看著一堆黑碼頭疼不已，葉沖發現這些其實是數獨游戲，解出來后確定了坐標，發現清泉純子調整過后的計劃，是和香港人民同歸于盡。池城連忙去安排轟炸，而葉沖再一次暈了過去。

葉沖昏迷了五天，再一次醒來是在醫院，諾亞計劃已經被他們徹底粉碎，日軍已經無條件投降，他們勝利了。葉沖要去延安找何櫻(穎兒 飾)，林小莊吐槽自己的地位越來越低了，不過他要求葉沖晚上一起和大家吃飯慶祝一下。池城來找靳香還錢，還拿出了一枚戒指，說要用自己的一輩子做利息，靳香十分開心。林小莊和葉沖在火車前告別后，葉沖便踏上了去延安的路。在即將到鄭州的路上，葉沖噴出了一口鮮血，他靠在車窗上，永遠的睡著了。在延安苦苦等待葉沖的何櫻，發現那件旗袍里有一封信，這是葉沖寫給她的。葉沖從來沒有去過延安，那是他最向往的地方，何櫻是他生命中最重要的人，他希望自己的太陽在一個足夠安全的地方發光發熱。葉沖希望何櫻在沒有他的地方好好生活，何櫻潸然淚下，原來她被葉沖送來延安時，就已經徹底離開他了。而葉沖，永遠的留在了這場戰爭中，即使沒有被所有人銘記，卻堅守了自己的本心。